电子游戏玩家或可通过游戏推进癌症研究

CRG 和 CNAG-CRG 今天推出了 GENIGMA,这是一款电子游戏,可以让玩家解决难题,同时生成真实世界的科学数据,这些数据可以检测基因组序列的变化并最终推进乳腺癌研究。

GENIGMA 标志

GENIGMA 游戏徽标 来源:CRG/CNAG-CRG

CRG 和 CNAG-CRG 发起了公民科学倡议#GenigmaChallenge。

CRG 和 CNAG-CRG 今天推出了 GENIGMA,这是一款电子游戏,可以让玩家解决难题,同时生成真实世界的科学数据,这些数据可以检测基因组序列的变化并最终推进乳腺癌研究

该游戏今天在iOS和Android上推出,并提供英语、西班牙语、加泰罗尼亚语和意大利语版本,是基因组中心的一组研究人员开发的为期两年半的公民科学项目的结果监管 (CRG)、Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG) 和游戏专业人士。

该游戏旨在促进依赖癌细胞系的全球研究工作,癌细胞系是科学家用研究癌症和测试治疗该疾病的新药的关键资源。癌细胞系的局限性之一是缺乏高分辨率的基因组参考图,这对于帮助研究人员解释他们的科学结果是必要的,例如精确定位具有治疗意义的基因或潜在突变位点的位置。

细胞系负责发现疫苗、癌症化学疗法或不孕症的体外受精。这使它们成为现代生物学的支柱,”ICREA 研究教授 Marc A. Marti-Renom 解释说,他同时隶属于CRG和CNAG-CRG,其研究支持 GENIGMA。“然而,缺乏基因组参考图限制了当前的科学进步。这就像要求人们使用过去的地图在现代城市中导航一样。在其他人的帮助下,我们可以更新这些地图,这将使我们在乳腺癌研究方面取得快速进展。”

Marti-Renom 教授的研究小组开发了通过在 3D 空间中可视化基因组来创建基因组参考图的方法。然而,这需要大量的时间和资源来训练人工智能,以及巨大的计算能力。

研究人员之所以推出 GENIGMA,是因为他们认为与单独使用 AI 相比,玩家生成的数据可能是更新参考地图的更有效方法。玩家的“群体智能”还可以以人工智能可能无法提供的方式提供创造性的解决方案。

要玩 GENIGMA,玩家必须解决一个涉及一串不同颜色和形状的块的谜题。每个字符串代表癌细胞系中的一个基因序列,玩家如何组织块是基因定位的潜在解决方案。

玩家必须重新组织积木,以便获得尽可能高的分数。玩家数量和得分越高,研究人员在参考地图中找到该特定位置的正确顺序的可能性就越高。

CRG 公民科学促进者 Elisabetta Broglio 说:“世界上任何地方拥有智能手机的任何人都可以免费下载 GENIGMA 并为研究做出直接贡献,将他们的逻辑和敏捷性用于科学服务。” “GENIGMA 将作为一个集体而不是作为个人来分析玩家提供的解决方案,并将利用确定性算法无法找到的创造性解决方案。”

GENIGMA 游戏玩法

GENIGMA 在智能手机上的游戏画面 来源:CRG/CNAG-CRG

研究人员将尝试解决的第一个基因组参考图谱是针对 T-47D 乳腺癌细胞系,这是癌症研究中最常用的资源之一。GENIGMA 的研究团队估计,平均每人解决 50 场比赛的 3 万名玩家将产生足够的数据来揭示该乳腺癌细胞系中 20.000 个基因的参考图谱。

该游戏于 2022 年 1 月 27 日推出,开展了为期三个月的活动—— #GenigmaChallenge。每周一,为期三个月,GENIGMA团队将引入来自T-47D细胞系的新基因组片段,由玩家安排。第一个需要排列的基因组片段来自 17 号染色体,其中包含大量的乳腺癌相关基因。这包括 BRCA1,其突变与约 40% 的遗传性乳腺癌有关。

VMB2600A科研用三目生物显微镜

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GENIGMA 的开发历时两年半,涉及 13 个研讨会的 500 多人。该游戏由来自不同背景的不同群体构思和测试,包括研究人员、学生、教师、艺术家、医学专业人士、生物伦理学家、记者、来自患者组织的代表、艺术家和游戏开发商。

JOCS al SEGON 的创意人员兼 GENIGMA 游戏设计团队的协调员 Oriol Ripoll 表示:“对于大多数人来说,科学常常感到难以接近,这就是为什么能够拿起手机玩 GENIGMA 如此令人兴奋的原因。您不仅可以结合电子游戏的普遍吸引力和流行度为推进医学研究做出贡献,您还将了解更多关于科学的知识。”

GENIGMA 由 ORION 资助,这是一个为期 4 年的项目,该项目已根据第 741527 号赠款协议获得了欧盟 Horizo​​n 2020 研究和创新计划的资助。该项目解决了 Horizo​​n 2020 在科学下对“SwafS-04-2016”的呼吁和社会工作计划。GENIGMA 也是与“Fondazione ANT Italia Onlus”和 Arima Genomics 合作的结果。


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